নিউক্লিক অ্যাসিড সংশ্লেষণ সলিড ফেজ সিয়ালিক অ্যামাইড ট্রাইগ্লিসারাইড পদ্ধতি ব্যবহার করে সঞ্চালিত হয়, যেখানে ডিএনএর 3′ প্রান্ত একটি কঠিন ফেজ সাবস্ট্রেটে স্থির থাকে এবং পছন্দসই ডিএনএ খণ্ডটি সংশ্লেষিত না হওয়া পর্যন্ত নিউক্লিওটাইডগুলি 3′ থেকে 5′ দিকে যুক্ত করা হয়। .এটি ডিএনএ পলিমারেজ প্রয়োগের মাধ্যমে ডিএনএ সংশ্লেষণ থেকে পৃথক।
প্রথম বেসের 3′ প্রান্তটি সংশ্লেষণের সময় CPG-এ স্থির থাকে, পরবর্তী বেসের 5′-OH ডি-পি-টলিল ট্রিটাইল ডিএমটি দিয়ে সুরক্ষিত থাকে, বেসের অ্যামিনো গ্রুপটি বেনজোয়িক অ্যাসিড দিয়ে সুরক্ষিত থাকে এবং 3′ -OH তারপর একটি অ্যামিনো ফসফেট যৌগ দিয়ে সক্রিয় করা হয়।1 বেসের 5 5′-OH এর 1 বেস এবং পরবর্তী বেসের 3′-OH একটি ফসফাইট ট্রাইগ্লিসারাইড তৈরি করে, যা আয়োডিন দিয়ে ফসফেট ট্রাইগ্লিসারাইডে অক্সিডাইজ করা হয়, দ্বিতীয় বেস 5′-OH এর সুরক্ষাকারী দ্বারা অপসারণ করা হয় পরবর্তী বেস যোগ করার মাধ্যমে ডিক্লোরোএসেটিক অ্যাসিড ডিএম চক্র যোগ করা হয়, এবং সংশ্লেষণের পরে 5′-OH-এর সুরক্ষাকারী একটি দুর্বল অ্যাসিড দিয়ে সরানো হয়। খণ্ডটি ঘনীভূত অ্যামোনিয়াম হাইড্রোক্সাইডের সাথে কঠিন রজন থেকে সংযোগ বিচ্ছিন্ন হয়, রক্ষাকারীটি ভিত্তি থেকে সরানো হয়। উত্তাপের অধীনে ঘনীভূত অ্যামোনিয়াম হাইড্রক্সাইডের সাথে, অ্যামোনিয়াম হাইড্রক্সাইড সরানো হয়, খণ্ডটি ভ্যাকুয়াম শুকানো হয় এবং নিউক্লিক অ্যাসিড তরল ক্রোমাটোগ্রাফি বা PAGE দ্বারা বিশুদ্ধ করা হয়।
অলিগো সংশ্লেষণের ধাপ
অবরোধ করা হচ্ছে
দ্যTCA সমাধান যোগ করে 5 শেষ DMT রক্ষাকারী গ্রুপ সরানো হয়।
সক্রিয়করণ
অ্যাক্টিভেটরকে অলিগোনিউক্লিওটাইড মনোমারের সাথে মিশিয়ে সক্রিয় অলিগোনিউক্লিওটাইড মনোমার মধ্যবর্তী গঠন করে।
কাপলিং
5-টার্মিনাল হাইড্রোক্সিল গ্রুপ একটি অস্থির ফসফাইট ট্রাইগ্লিসারাইড বন্ধন গঠনের জন্য একটি অ্যান্টি-জেনারেটিভ ঘনীভবন বিক্রিয়ায় সক্রিয় অলিগোনিউক্লিওটাইড মধ্যবর্তীর সাথে বিক্রিয়া করে।
ক্যাপিং
একটি ক্যাপিং এজেন্ট সংযোজন অতিরিক্ত হাইড্রোক্সিল গ্রুপের সাথে একটি অ্যাসিটাইলেশন ক্যাপিং প্রতিক্রিয়া সঞ্চালন করে যা ঘনীভূত প্রতিক্রিয়ার সাথে জড়িত নয়।
জারণ
জল ধারণকারী আয়োডিন দ্রবণ অক্সিডেশন দ্বারা অস্থির ফসফাইট বন্ধনের সাথে বিক্রিয়া করে স্থিতিশীল ফসফরিক অ্যাসিড ট্রাইগ্লিসারাইড বন্ধন তৈরি করে।
সায়ানোইথিল বিভাজন
ফসফেট ট্রাইগ্লিসারাইড বন্ড থেকে সায়ানোইথাইল গ্রুপ অপসারণের জন্য ডিইএ দ্রবণ যোগ করে সংশ্লেষণের পর নিউক্লিক অ্যাসিড পণ্য।
ক্লিভড এবং ডিপ্রোটেকশন
ঘনীভূত অ্যামোনিয়াম হাইড্রোক্সাইড দ্রবণ যোগ করে নিউক্লিক অ্যাসিডের টুকরোগুলিকে কঠিন ফেজ ক্যারিয়ার থেকে বিচ্ছিন্ন করা হয় এবং তারপরে ঘাঁটির হাইড্রোজেন বন্ধন থেকে রক্ষাকারী গোষ্ঠীগুলিকে সরিয়ে দেওয়ার জন্য উত্তপ্ত করা হয়।
পোস্টের সময়: নভেম্বর-২১-২০২২